2006年1月，发展改革委第三号公告批准通州光机电基地、环保园区纳入中关村科技园区政策区范围。同年5月，经中关村管委会同意、通州区编办批准，成立中关村科技园区通州园管理委员会，标志着通州园光机电一体化产业基地、金桥科技产业基地纳入中关村科技园区政策区范围，规划占地面积1450公顷。2012年10月，经国务院批复，调整中关村示范区空间规模和布局，通州园在光机电、金桥两个基地的基础上，将通州经济开发区东区、西区、南区，北京永乐经济开发区，通州运河核心区，北京环渤海高端总部基地，北京通州国际种业科技园，北京国际医疗服务区8个分园纳入到中关村示范区政策区范围，规划占地面积3434.46公顷。光机电基地纳入面积596公顷，重点打造总部经济、中小企业创新集群与现代制造业产业集群。金桥基地纳入面积1020公顷，重点打造以集成电路为主导，以能源环保、生物医药为重要支撑的现代产业体系。开发区西区纳入面积443公顷，重点发展电子信息和以航空零部件为特色的装备制造，培育发展以商务服务和科技服务为核心的生产性服务业;东区纳入面积278公顷，着重打造以汽车零部件为主导，智能电网装备、生物医药为支撑的产业体系;南区纳入面积171公顷，重点发展新材料特色产业，培育发展生物医药、专用装备制造产业。永乐开发区纳入面积231公顷，重点打造北京市生物医药产业基地和通州区高端装备制造业基地。国际种业园纳入面积13公顷，重点发展种业研发交易和种业总部经济，打造研、育、繁、推、展、销一体化产业链协同创新示范区，农业种业政策创新试点区。国际医疗服务区纳入面积26公顷，是补充基本医疗、提供高端医疗健康服务、健全医疗产业发展体系的医疗产业聚集区。环渤海总部基地纳入面积290公顷，以高端企业总部聚集为目标，重点发展战略性新兴产业和以文化创意产业为代表的现代服务业，形成城业共兴的创新创业新城。运河核心区纳入面积367公顷，重点发展商务服务，配套发展金融服务，打造与北京建设世界城市相匹配的城市副中心核心区。园区建立起信息服务平台、就业服务平台、人才培训基地和融资绿色通道，实现企业网上申报，政府网上办公，政企时时互动的服务模式，通过提供全方位、高质量、高效率的服务，降低企业商务成本，减轻企业负担。园区内企业可享受国家、北京市、中关村示范区的各类优惠政策。